2015年，保护区与中国科学院动物研究所合作开展了华南梅花鹿种群规划编制，为华南梅花鹿种群发展提供方向。

自2018年以来，保护区与中国计量大学共同开展野生华南梅花鹿种群数量及空间分布格局、栖息地适宜性分析、谱系分析与个体识别、繁育基地种群健康评估、野外放归及综合监测等科研监测工作，并取得大量成果，为保护区落实科学保护举措提供技术支撑。

截至目前，保护区在华南梅花鹿活动区域共布设红外相机115台，收集红外相机有效照片120万张，视频170余小时。

建成含多个功能区及视频监控设备的华南梅花鹿半生态驯养繁育试验基地，建立全省首个“华南梅花鹿抢救保护基地”。

完成540公顷范围的华南梅花鹿栖息地生态环境恢复，为梅花鹿提供生存栖息所需的活动通道及食物。

同时，成功实施全国首次华南梅花鹿野外放归，76头梅花鹿在野外“安家落户”，其中17头梅花鹿佩戴了野生动物追踪项圈，为进一步了解梅花鹿家域、栖息地选择及栖息节律提供重要支撑。